基本信息
職稱：研究員
電話：021-31246742
郵箱：chend@fudan.edu.cn
地址：万博英超狼队网官方网 E301-2
個人簡介（工作經曆）
万博英超狼队网官方网 教授、遺傳工程國家重點實驗室PI、狗万外围充值 附屬中山醫院雙聘教授，博士生導師。2008年畢業於中國科學技術大學，細胞生物學博士。畢業後赴美國貝勒醫學院從事生物質譜和蛋白質組學博士後研究工作。2012年全職回國在北京蛋白質組研究中心任副研究員、研究員。2015年加入万博英超狼队网官方网 。目前擔任中國生物物理學會表型組學分會創會秘書長、Springer Nature旗下《Phenomics》雜誌創刊執行主編、國家十四五重點研發計劃“生物大分子與微生物”首席科學家、入選國家高層次人才特殊計劃、國家海外高層次人才計劃、北京市“海聚工程”、北京市“優秀青年人才”、上海市“曙光人才”、上海市“優秀學科帶頭人”。近五年在Nat Biotechnol、Adv Sci、Sci Adv、JHO、Hepatology、Nat Commun等雜誌發表文章69篇，其中獨立/共同通訊SCI論文38篇，被引4100次；獲批中/美專利5項，申請中國專利10項。
研究方向
主要從事基於蛋白質組的轉錄調控解析研究：開發一站式蛋白質組數據雲平台Firmiana；建立了內源性轉錄因子活性分析技術（catTFRE）;轉錄因子DNA修飾結合偏好性解析技術（modi-TFRE）；染色質開放域轉錄調控蛋白質機器解析技術（ATAC-MS）。利用多維度組學解析了膠質瘤、胃癌、肝癌、多器官鱗癌、膀胱癌、胰腺導管癌、膽管癌等隊列的多維度分子調控網絡圖景。
招生專業
生物化學與分子生物學
獲獎情況
2013年北京市第九批“海聚工程”
2014年北京市第七批“優秀青年人才”
2019年上海市“曙光人才”
2022年上海市“優秀學科帶頭人”
代表性論文和論著
1. Tong, Y., Sun, M., Chen, L., Wang, Y., Li, Y., Li, L., . . . Ding, C.* (2022). Proteogenomic insights into the biology and treatment of pancreatic ductal adenocarcinoma. J Hematol Oncol, 15(1), 168. doi:10.1186/s13045-022-01384-3
2. Xu, N., Yao, Z., Shang, G., Ye, D., Wang, H., Zhang, H., . . . Ding, C.* (2022). Integrated proteogenomic characterization of urothelial carcinoma of the bladder. J Hematol Oncol, 15(1), 76. doi:10.1186/s13045-022-01291-7
3. Qie, J., Liu, Y., Wang, Y., Zhang, F., Qin, Z., Tian, S., . . . Ding, C.*(2022). Integrated proteomic and transcriptomic landscape of macrophages in mouse tissues. Nat Commun, 13(1), 7389. doi:10.1038/s41467-022-35095-7
4. Li, Y., Xu, C., Wang, B., Xu, F., Ma, F., Qu, Y., . . . Ding, C.* (2022). Proteomic characterization of gastric cancer response to chemotherapy and targeted therapy reveals new therapeutic strategies. Nat Commun, 13(1), 5723. doi:10.1038/s41467-022-33282-0
5. Deng, M., Ran, P., Chen, L., Wang, Y., Yu, Z., Cai, K., . . . Ding, C.* (2022). Proteogenomic characterization of cholangiocarcinoma. Hepatology, 77(2), 411-429. doi:10.1002/hep.32624
6. Qu, Y., Feng, J., Wu, X., Bai, L., Xu, W., Zhu, L., . . . Ding, C.*(2022). A proteogenomic analysis of clear cell renal cell carcinoma in a Chinese population. Nat Commun, 13(1), 2052. doi:10.1038/s41467-022-29577-x
7. Qu, Y., Wu, X., Anwaier, A., Feng, J., Xu, W., Pei, X., . . . Ding, C.* (2022). Proteogenomic characterization of MiT family translocation renal cell carcinoma. Nat Commun, 13(1), 7494. doi:10.1038/s41467-022-34460-w
8. Zhang, H., Qin, Z., Yue, X., Liu, Y., Sun, X., Feng, J., . . . Ding, C.* (2021). Proteome-wide profiling of transcriptional machinery on accessible chromatin with biotinylated transposons. Sci Adv, 7(43), eabh1022. doi:10.1126/sciadv.abh1022
9. Bai, L., Yang, G., Qin, Z., Lyu, J., Wang, Y., Feng, J., . . . Ding, C.* (2021). Proteome-Wide Profiling of Readers for DNA Modification. Adv Sci (Weinh), 8(19), e2101426. doi:10.1002/advs.202101426
10. Wang, Y., Song, L., Liu, M., Ge, R., Zhou, Q., Liu, W., . . . Ding, C.*(2018). A proteomics landscape of circadian clock in mouse liver. Nat Commun, 9(1), 1553. doi:10.1038/s41467-018-03898-2
11. Feng, J., Ding, C.*, Qiu, N., Ni, X., Zhan, D., Liu, W., . . . Qin, J*. (2017). Firmiana: towards a one-stop proteomic cloud platform for data processing and analysis. Nat Biotechnol, 35(5), 409-412. doi:10.1038/nbt.3825